医院设有神经内科、心血管内科、呼吸内科、消化内科、肝胆内科、肾内科、内分泌科、风湿血液科、肿瘤科、重症医学科、急诊科、普通外科、神经外科、胸心外科、肝胆外科、肿瘤外科、泌尿外科、骨伤科一区、骨伤科二区、骨伤科三区、骨伤科四区、骨伤科五区、骨伤科六区、骨伤科七区、骨伤科八区、骨伤科九区、骨伤科十区、骨伤科十一区、骨伤科十二区、手外科、中医正骨科、妇科、产科、儿科、新生儿科、眼科、耳鼻咽喉科、口腔科、康复医学科、手术室、麻醉科、中医内科、肛肠科、皮肤科、体检中心、高压氧室、影像科、超声诊断科、药剂科、医学检验科、病理科、输血科等临床和医技科室。
一、国家重点中西医结合专科：骨伤科、重症医学科。
二、福建省临床重点专科：骨科、康复科。
三、福建省中医重点专科：神经外科、康复科、心血管内科、骨伤科、急诊科。
四、福州市中西医结合重点专科：呼吸内科、肝胆内科、肾内科、内分泌科、儿科、重症医学科、肿瘤科、消化内科、神经内科、神经外科、心血管内科。
五、福州市临床重点专科：骨科、康复科。
一、优势病种：脊柱脊髓损伤、脊柱退行性疾病(颈椎病、胸腰椎管狭窄症、腰椎间盘突出症、腰椎不稳、腰椎滑脱、退行性腰椎侧弯等)、脊柱畸形、脊柱脊髓肿瘤、脊柱炎症、截瘫、四肢骨折后关节功能障碍、偏瘫、颈椎病、腰腿痛、椎管内肿瘤、脑肿瘤、颅脑创伤、脑血管疾病、脑梗塞、脑出血、头痛、头晕、帕金森综合征、格林巴利综合征、周围神经病变、癫痫、痴呆、脊髓炎、颅内感染、多系统萎缩、冠心病、心律失常、心力衰竭、心肌病变、高血脂、高血压病、乳腺癌、胃癌、肠癌、肠梗阻、阑尾周围脓肿、胆囊炎胆石症慢性食管炎，反流性食管炎、barrett食管炎、贲门失迟缓症、食管癌、霉菌性食管炎、慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌、胃石症、上消化道出血、急慢性肝炎、肝硬化、肝性脑病、肝癌、急慢性胰腺炎、胰腺癌、胃肠炎、急性肠炎、溃疡性结肠炎、克隆病、肠结核、结肠癌。
二、优势技术：重建前后交叉韧带、半月板缝合修复技术、软骨微骨折技术、软骨移植技术、膝关节脱位重建技术、踝关节撞击及肩袖修补、肩关节不稳重建、人工全髋关节置换、表面髋关节置换、双动股骨头置换、各种髋关节假体翻修术、膝关节单髁置换、表面置换、微创膝关节表面置换、各种翻修手术、胫骨、股骨、肱骨等交锁髓内钉内固定、各种钢板内固定、外固定架固定技术、股骨颈骨折的空心钉内固定术、粗隆间骨折PFNA、股骨髁间髁上骨折前外侧小切口复位经皮钢板穿板固定技术、肱骨近端骨折闭合复位交锁髓内钉内固定技术折、肱骨近端骨折微创小切口经皮钢板板固定技术（MIPPO技术）、冠状动脉造影术、PTCA、冠状动脉内支架成形术、射频消融术以及心脏起搏器安装术。
